মূল পার্থক্য – আলফা হেলিক্স বনাম বিটা প্লেটেড শিট
আলফা হেলিসিস এবং বিটা প্লিটেড শীট হল একটি পলিপেপটাইড চেইনের মধ্যে দুটি সর্বাধিক পাওয়া গৌণ কাঠামো। এই দুটি কাঠামোগত উপাদান একটি পলিপেপটাইড চেইন ভাঁজ করার প্রক্রিয়ার প্রথম প্রধান ধাপ। আলফা হেলিক্স এবং বিটা প্লেটেড শীটের মধ্যে মূল পার্থক্য তাদের গঠনে; একটি নির্দিষ্ট কাজ করার জন্য তাদের দুটি ভিন্ন আকার আছে৷
আলফা হেলিক্স কি?
একটি আলফা হেলিক্স হল একটি পলিপেপটাইড চেইনে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের একটি ডান হাতের কুণ্ডলী। অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের পরিসীমা 4 থেকে 40 অবশেষের মধ্যে পরিবর্তিত হতে পারে।উপরের কুণ্ডলীর C=O গ্রুপের অক্সিজেন এবং নিচের কুণ্ডলীর N-H গ্রুপের হাইড্রোজেনের মধ্যে যে হাইড্রোজেন বন্ধন তৈরি হয় তা কুণ্ডলীটিকে একসাথে ধরে রাখতে সাহায্য করে। উপরের পদ্ধতিতে শৃঙ্খলে প্রতি চারটি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশে একটি হাইড্রোজেন বন্ধন তৈরি হয়। এই অভিন্ন প্যাটার্ন এটিকে নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্য দেয় যেমন কয়েলের পুরুত্ব এবং এটি হেলিক্স অক্ষ বরাবর প্রতিটি সম্পূর্ণ বাঁকের দৈর্ঘ্য নির্দেশ করে। আলফা হেলিক্স গঠনের স্থায়িত্ব বিভিন্ন কারণের উপর নির্ভর করে।
O পরমাণু লাল রঙে, N পরমাণু নীল রঙে এবং হাইড্রোজেন বন্ড সবুজ ডটেড লাইন হিসেবে
বিটা প্লেটেড শীট কি?
বিটা প্লিটেড শীট, যা বিটা শীট নামেও পরিচিত, প্রোটিনের সেকেন্ডারি কাঠামোর দ্বিতীয় রূপ হিসাবে বিবেচিত হয়। এটিতে বিটা স্ট্র্যান্ড রয়েছে যা ন্যূনতম দুই বা তিনটি ব্যাকবোন হাইড্রোজেন বন্ড দ্বারা পার্শ্বীয়ভাবে সংযুক্ত থাকে যাতে চিত্রে দেখানো হিসাবে একটি পেঁচানো, pleated শীট তৈরি করা হয়।একটি বিটা স্ট্র্যান্ড হল পলিপেপটাইড চেইনের একটি প্রসারিত; এটির দৈর্ঘ্য সাধারণত 3 থেকে 10 অ্যামিনো অ্যাসিডের সমান, একটি বর্ধিত নিশ্চিতকরণে মেরুদণ্ড সহ।
এনজাইম ক্যাটালেসের একটি স্ফটিক কাঠামো থেকে 4-অসন্তস্থ অ্যান্টি-প্যারালাল β শীট খণ্ড।
a) সংলগ্ন স্ট্র্যান্ডে পেপটাইড NH এবং CO গ্রুপের মধ্যে অ্যান্টি-সমান্তরাল হাইড্রোজেন বন্ধন (ডটেড) দেখাচ্ছে। তীরগুলি চেইনের দিক নির্দেশ করে এবং ইলেক্ট্রন ঘনত্বের রূপরেখাগুলি অ-এইচ পরমাণুর রূপরেখা দেয়। O পরমাণুগুলি লাল বল, N পরমাণুগুলি নীল, এবং H পরমাণুগুলি সরলতার জন্য বাদ দেওয়া হয়; সাইডচেইনগুলি শুধুমাত্র প্রথম সাইডচেইন সি পরমাণুতে দেখানো হয় (সবুজ)
b) কেন্দ্রীয় দুটি β স্ট্র্যান্ডের এজ-অন ভিউ
বিটা প্লেটেড শীটে, পলিপেপটাইড চেইন একে অপরের পাশাপাশি চলে।গঠনটির তরঙ্গের মতো চেহারার কারণে এটি "pleated শীট" নাম পায়। তারা হাইড্রোজেন বন্ড দ্বারা একসাথে সংযুক্ত করা হয়. এই কাঠামো পলিপেপটাইড চেইন প্রসারিত করে আরও হাইড্রোজেন বন্ধন গঠনের অনুমতি দেয়।
আলফা হেলিক্স এবং বিটা প্লেটেড শীটের মধ্যে পার্থক্য কী?
আলফা হেলিক্স এবং বিটা প্লেটেড শীটের গঠন
আলফা হেলিক্স:
এই কাঠামোতে, পলিপেপটাইড মেরুদণ্ড একটি সর্পিল কাঠামো হিসাবে একটি কাল্পনিক অক্ষের চারপাশে শক্তভাবে আবদ্ধ থাকে। এটি পেপটাইড চেইনের হেলিকয়েডাল বিন্যাস নামেও পরিচিত।
আলফা হেলিক্স কাঠামোর গঠন ঘটে যখন পলিপেপটাইড চেইনগুলি একটি সর্পিল হয়ে যায়। এটি চেইনের সমস্ত অ্যামিনো অ্যাসিডকে একে অপরের সাথে হাইড্রোজেন বন্ড (একটি অক্সিজেন অণু এবং একটি হাইড্রোজেন অণুর মধ্যে একটি বন্ধন) গঠন করতে সক্ষম করে। হাইড্রোজেন বন্ড হেলিক্সকে সর্পিল আকৃতি ধরে রাখতে দেয় এবং একটি টাইট কয়েল দেয়। এই সর্পিল আকৃতি আলফা হেলিক্সকে খুব শক্তিশালী করে তোলে।
হাইড্রোজেন বন্ড হলুদ বিন্দু দ্বারা নির্দেশিত হয়।
বিটা প্লেটেড শীট:
যখন পলিপেপটাইড চেইন(গুলি) এর দুই বা ততোধিক খন্ড একে অপরের সাথে ওভারল্যাপ করে, একে অপরের সাথে হাইড্রোজেন বন্ধনের সারি তৈরি করে, নিম্নলিখিত কাঠামোগুলি পাওয়া যায়। এটা দুইভাবে ঘটতে পারে; সমান্তরাল বিন্যাস এবং বিরোধী সমান্তরাল বিন্যাস।
গঠনের উদাহরণ:
আলফা হেলিক্স: আঙ্গুলের নখ বা পায়ের নখ একটি আলফা হেলিক্স গঠনের উদাহরণ হিসেবে নেওয়া যেতে পারে।
বিটা প্লেটেড শীট: পালকের গঠন বিটা প্লেটেড শীটের গঠনের অনুরূপ।
কাঠামোর বৈশিষ্ট্য:
আলফা হেলিক্স: আলফা হেলিক্সের গঠনে, প্রতি হেলিক্সে ৩.৬টি অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে।সমস্ত পেপটাইড বন্ধন ট্রান্স এবং প্ল্যানার এবং পেপটাইড বন্ডের N-H গ্রুপগুলি একই দিকে নির্দেশ করে, যা হেলিক্সের অক্ষের প্রায় সমান্তরাল। সমস্ত পেপটাইড বন্ধনের C=O গ্রুপগুলি বিপরীত দিকে নির্দেশ করে এবং তারা হেলিক্সের অক্ষের সমান্তরাল। প্রতিটি পেপটাইড বন্ডের C=O গ্রুপ একটি হাইড্রোজেন বন্ড গঠন করে পেপটাইড বন্ডের N-H গ্রুপের সাথে আবদ্ধ হয়। সমস্ত R- গ্রুপ হেলিক্স থেকে বাইরের দিকে নির্দেশিত।
বিটা প্লেটেড শীট: বিটা প্লেটেড শীটের প্রতিটি পেপটাইড বন্ড প্ল্যানার এবং ট্রান্স-কনফরমেশন রয়েছে। পার্শ্ববর্তী চেইন থেকে পেপটাইড বন্ধনের C=O এবং N-H গ্রুপগুলি একই সমতলে থাকে এবং তাদের মধ্যে হাইড্রোজেন বন্ধন তৈরি করে একে অপরের দিকে নির্দেশ করে। যেকোনো চেইনের সমস্ত R- গ্রুপগুলি বিকল্পভাবে শীটের সমতলের উপরে এবং নীচে ঘটতে পারে৷
সংজ্ঞা:
সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার: এটি একটি ভাঁজ করা প্রোটিনের আকৃতি যা এর ব্যাকবোন অ্যামাইড এবং কার্বনিল গ্রুপের মধ্যে হাইড্রোজেন বন্ধনের কারণে।
