ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিডের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড হল একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস যা ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করার জন্য যখন ইস্ট টু হাইব্রিড প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করার জন্য একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস।
সেলুলার অণুর মধ্যে মিথস্ক্রিয়া অধ্যয়ন করা জিনের অভিব্যক্তি এবং প্রোটিন পথের সাথে জড়িত স্বীকৃতি সাইটগুলিকে সংজ্ঞায়িত করতে সহায়তা করতে পারে। ডিএনএ এবং প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া সেলুলার প্রক্রিয়াগুলির অবিচ্ছেদ্য অংশ যেমন ডিএনএ পরিবর্তন এবং ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেশন, ইত্যাদি। অন্যদিকে, প্রোটিন এবং প্রোটিন মিথস্ক্রিয়াগুলি সেলুলার প্রক্রিয়া যেমন প্রতিলিপি, প্রতিলিপি, অনুবাদ এবং সংকেত ট্রান্সডাকশনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।অতএব, বিভিন্ন অ্যাসের মাধ্যমে সেলুলার অণুর এই মিথস্ক্রিয়াগুলি সনাক্ত করা সমালোচনামূলকভাবে গুরুত্বপূর্ণ। ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিড হল দুটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাসেস যা ডিএনএ-প্রোটিন এবং প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করে৷
ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড কি?
ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড (Y1H) হল একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস যা অন্তঃকোষীয় ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করতে পারে। এই পদ্ধতিটি প্রথম 1993 সালে ওয়াং এবং রিড দ্বারা প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল। তারপর থেকে, এটি জৈবিক গবেষণায় একটি বৃহত্তর শক্তি দেখিয়েছে। এই পরীক্ষায়, দুটি প্রধান উপাদান রয়েছে: ডিএনএ টোপ এবং প্রোটিন শিকার।
চিত্র 01: ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড
প্রক্রিয়ায়, একটি ডিএনএ সিকোয়েন্স (ডিএনএ টোপ) প্রথমে দুটি ভিন্ন রিপোর্টারের (HIS3, LacZ) আপস্ট্রিম ক্লোন করা হয়।এই প্রতিবেদক গঠনগুলি একটি খামির স্ট্রেনের জিনোমে একত্রিত হয়। ট্রান্সক্রিপশনাল কারণগুলি প্রোটিন শিকার হিসাবে নেওয়া হয়। ট্রান্সক্রিপশনাল ফ্যাক্টরগুলিকে হাইব্রিড প্রোটিন তৈরি করার জন্য খামির Gal4 ট্রান্সক্রিপশনাল ফ্যাক্টরের ট্রান্সক্রিপশনাল অ্যাক্টিভেশন ডোমেনে (AD) মিশ্রিত করা হয়। এই সম্পূর্ণ হাইব্রিড প্রোটিনটি খামিরের স্ট্রেনে প্রবর্তনের আগে একটি প্লাজমিডে একত্রিত হয়। রিকম্বিন্যান্ট প্লাজমিডের প্রবর্তনের পর, যখন ট্রান্সক্রিপশনাল ফ্যাক্টর ডিএনএ খণ্ডের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে, তখন AD moiety রিপোর্টার জিন এক্সপ্রেশন (HIS3or LacZ) সক্রিয় করে। প্লাজমিডের সিকোয়েন্সিং ট্রান্সক্রিপশনাল ফ্যাক্টর সনাক্ত করতে দেয় যা ডিএনএ খণ্ডের সাথে আবদ্ধ হতে পারে। সম্প্রতি, রোগ নির্ণয়ের গবেষণার জন্য খামির এক হাইব্রিড পদ্ধতি ব্যবহার করা হয়েছিল। অতএব, ভবিষ্যতে, এই পরীক্ষাটি বৈজ্ঞানিক গবেষণা এবং চিকিৎসায় আরও ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হবে৷
ইস্ট টু হাইব্রিড কি?
ইস্ট টু হাইব্রিড (Y2H) হল একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস যা অন্তঃকোষীয় প্রোটিন এবং প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করতে পারে।এই পদ্ধতিটি মূলত 1989 সালে স্ট্যানলি ফিল্ডস এবং ওকে-কিউ সং দ্বারা পাওয়া যায়। এই কৌশলটি খামিরের Gal4 ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর ব্যবহার করে প্রোটিন-প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া সনাক্ত করে।
চিত্র 02: ইস্ট টু হাইব্রিড
এই পদ্ধতিতে, আগ্রহের প্রোটিন ব্যবহার করে প্রথমে দুটি ফিউশন (হাইব্রিড) তৈরি করা হয়: একটি প্রোটিনকে ডিএনএ বাইন্ডিং ডোমেন (DBD) দিয়ে এবং অন্য প্রোটিনকে Gal4 ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের অ্যাক্টিভেটর ডোমেনের (AD) সাথে ফিউজ করে।. ডিবিডির সাথে মিশ্রিত প্রোটিনকে টোপ বলা হয়, যখন AD এর সাথে মিশ্রিত প্রোটিন শিকার হিসাবে পরিচিত। ইস্ট স্ট্রেনে, টোপ এবং শিকারের মিথস্ক্রিয়ায়, রিপোর্টার জিনের আপস্ট্রিমে একটি কার্যকরী Gal4 ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর তৈরি করতে DBD এবং AD কাছাকাছি আনা হয়।কার্যকরী ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর রিপোর্টার জিনের অভিব্যক্তি সক্রিয় করে। অধিকন্তু, এই পদ্ধতিটি বর্তমানে স্তন্যপায়ী কোষে অবিচ্ছেদ্য ঝিল্লি প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া স্ক্রীন করতে ব্যবহৃত হয়।
ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিডের মধ্যে মিল কী?
- ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিড দুটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাসেস যা ডিএনএ-প্রোটিন এবং প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করে।
- এই অ্যাসেগুলি খামিরের স্ট্রেন ব্যবহার করে।
- উভয় অ্যাসেই Gal4 ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের অ্যাক্টিভেশন ডোমেন (AD) ব্যবহার করে।
- তারা ইন্টারঅ্যাকশন সনাক্ত করতে রিপোর্টার জিন (HIS3, বা LacZ) এক্সপ্রেশন ব্যবহার করে।
- তাদের টোপ ও শিকার আছে।
- আধুনিক জৈবিক গবেষণায় উভয় পরীক্ষাই অত্যন্ত উপযোগী।
ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিডের মধ্যে পার্থক্য কী?
ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড হল ডিএনএ এবং প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করার জন্য একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস যখন ইস্ট টু হাইব্রিড প্রোটিন এবং প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করার জন্য একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস।সুতরাং, এটি খামির এক হাইব্রিড এবং খামির দুটি হাইব্রিডের মধ্যে মূল পার্থক্য। তদ্ব্যতীত, খামির এক হাইব্রিডে, টোপ হল একটি ডিএনএ খণ্ড, এবং শিকার হল একটি প্রোটিন অণু। অন্যদিকে, খামির দুটি হাইব্রিড, টোপ এবং শিকার উভয়ই প্রোটিন অণু।
নীচের ইনফোগ্রাফিক পাশাপাশি তুলনা করার জন্য ছক আকারে খামির এক সংকর এবং খামির দুই সংকরের মধ্যে পার্থক্যগুলি তালিকাভুক্ত করে৷
সারাংশ – ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড বনাম ইস্ট টু হাইব্রিড
ইস্ট এক হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিড দুটি গুরুত্বপূর্ণ ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাসে। ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড হল ডিএনএ এবং প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করার জন্য একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস যখন ইস্ট টু হাইব্রিড প্রোটিন এবং প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ করার জন্য একটি ইন ভিট্রো ভিত্তিক অ্যাস। সুতরাং, ইস্ট ওয়ান হাইব্রিড এবং ইস্ট টু হাইব্রিডের মধ্যে এটিই মূল পার্থক্য।
