কী পার্থক্য – এক্সোম বনাম আরএনএ সিকোয়েন্সিং
নিউক্লিক অ্যাসিড সিকোয়েন্সিং এমন একটি কৌশল যা একটি জীবের ডিএনএ বা আরএনএর একটি নির্দিষ্ট অংশে নিউক্লিওটাইডের ক্রম নির্ধারণ করে। কোষের ডিএনএ এবং আরএনএ মেকআপ শনাক্ত করতে এবং কার্যকরী প্রোটিনের জন্য কোড করে এমন কিছু জিনকে আলাদা করতে সিকোয়েন্সিং গুরুত্বপূর্ণ; এইভাবে, এই জিন এবং জিনের অভিব্যক্তিগুলির মিউটেশনগুলি বোঝার জন্য সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করা যেতে পারে। সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি বা আরও উন্নত নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি হল সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা সাধারণত ব্যবহৃত হয়। এক্সোম সিকোয়েন্সিং হল একটি জীবে উপস্থিত এক্সন বা কোডিং ডিএনএ অঞ্চলের সম্পূর্ণ সেটের সিকোয়েন্সিং যেখানে আরএনএ সিকোয়েন্সিং হল রিবোনিউক্লিক অ্যাসিড (আরএনএ) এর সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি।এটি এক্সোম এবং আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে মূল পার্থক্য৷
এক্সোম সিকোয়েন্সিং কি?
Exome হল জিনোমের একটি উপসেট যা একটি নির্দিষ্ট জীবের কোডিং জিন নিয়ে গঠিত। কোডিং জিনগুলিকে এক্সন হিসাবে নামকরণ করা হয় এবং এমআরএনএতে প্রতিলিপি করা হয় এবং তারপরে অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সে অনুবাদ করা হয়। পোস্ট ট্রান্সক্রিপশনাল পরিবর্তনের সময়, ইউক্যারিওটে আরএনএ স্প্লাইসিং মেকানিজম ইন্ট্রোন (নন কোডিং অঞ্চল) সরিয়ে দেয় এবং এক্সনগুলি থেকে যায়। দুটি প্রধান কৌশল রয়েছে যেখানে এক্সোম সিকোয়েন্সিং করা হয়: সমাধান ভিত্তিক এবং অ্যারে ভিত্তিক৷
সলিউশন-ভিত্তিক এক্সোম সিকোয়েন্সিং-এ, ডিএনএ নমুনাগুলি সীমাবদ্ধ এনজাইম বা যান্ত্রিক পদ্ধতি ব্যবহার করে খণ্ডিত করা হয় এবং তাপ দ্বারা বিকৃত করা হয়। এই কৌশলে, বায়োটিনিলেটেড অলিগোনিউক্লিওটাইড প্রোবগুলি (টোপ) জিনোমের লক্ষ্যবস্তু অঞ্চলগুলির সাথে বেছে বেছে হাইব্রিডাইজ করার জন্য ব্যবহার করা হয়। চৌম্বকীয় streptavidin জপমালা বাঁধাই ধাপের জন্য ব্যবহার করা হয়. বাইন্ডিং একটি ওয়াশিং স্টেপ দ্বারা অনুসরণ করা হয় যেখানে আনবাউন্ড এবং অ-টার্গেটেড সিকোয়েন্সগুলি ধুয়ে ফেলা হয়।পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (পিসিআর) ব্যবহার করে আবদ্ধ লক্ষ্যগুলিকে বিবর্ধিত করা হয় এবং তারপর সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং বা নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং কৌশল ব্যবহার করে সিকোয়েন্স করা হয়।
চিত্র 01: এক্সোম সিকোয়েন্সিং
অ্যারে ভিত্তিক পদ্ধতিটিও সমাধান ভিত্তিক পদ্ধতির অনুরূপ, ডিএনএ টুকরোগুলিকে একটি মাইক্রো অ্যারেতে ক্যাপচার করা হয় এবং তারপরে ক্রমিক হওয়ার আগে বাঁধাই এবং ধোয়ার পদক্ষেপগুলি অনুসরণ করা হয়৷
এক্সোম সিকোয়েন্সিং অনেক অ্যাপ্লিকেশনে ব্যবহৃত হয় যেমন রোগের জেনেটিক নির্ণয়, জিন থেরাপিতে, নতুন জেনেটিক মার্কার শনাক্ত করতে, কৃষিতে বিভিন্ন উপকারী কৃষিগত বৈশিষ্ট্য সনাক্ত করতে এবং উদ্ভিদ প্রজনন পদ্ধতিতে।
RNA সিকোয়েন্সিং কি?
RNA সিকোয়েন্সিং ট্রান্সক্রিপ্টোমের উপর ভিত্তি করে, যা কোষের সম্পূর্ণ প্রতিলিপি।আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের মূল লক্ষ্যগুলি হল mRNA, নন-কোডিং আরএনএ এবং ছোট আরএনএ সহ ট্রান্সক্রিপ্টের সমস্ত প্রজাতির ক্যাটালগ করা, জিনের ট্রান্সক্রিপশনাল গঠন নির্ধারণ করা এবং বিকাশের সময় প্রতিটি ট্রান্সক্রিপ্টের অভিব্যক্তির মাত্রা পরিমাপ করা। আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের সময়, হাইব্রিডাইজেশন প্রযুক্তি (যা পরিপূরক ডিএনএ ছিল পরিপক্ক এমআরএনএ সিকোয়েন্স থেকে প্রাপ্ত) প্রাথমিকভাবে সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল। বর্তমানে, আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য আরও সঠিক এবং একটি উন্নত থ্রু-পুট কৌশল ব্যবহৃত হয়।
চিত্র 02: আরএনএ সিকোয়েন্সিং
RNA সিকোয়েন্সিং-এ, RNA-এর একটি নমুনা যা মোট RNA বা ভগ্নাংশ RNA হতে পারে তার পরিপূরক DNA (cDNA) তে বিপরীত ট্রান্সক্রিপশন ব্যবহার করে রূপান্তরিত হয় এবং একটি cDNA লাইব্রেরি প্রস্তুত করা হয়। প্রতিটি সিডিএনএ ফ্র্যাগমেন্ট উভয় পাশে অ্যাডাপ্টারের সাথে সংযুক্ত থাকে (পেয়ার এন্ড সিকোয়েন্সিং) বা একপাশে (একক শেষ সিকোয়েন্সিং)।এই ট্যাগ করা সিকোয়েন্সগুলো স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং বা নেক্সট জেনারেশন ব্যবহার করে সিকোয়েন্স করা হয়, যেমন এক্সোম সিকোয়েন্সিং।
এক্সোম এবং আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে মিল কী?
- ছোট নির্বাচিত টুকরা বা ডিএনএ/আরএনএর সম্পূর্ণ সেট Exome বা RNA সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে।
- অনুক্রমিক টুকরোগুলো লাইব্রেরিতে সংরক্ষিত আছে।
- স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং বা নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করা যেতে পারে।
- দুটিই ভিট্রো সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি।
- অনুক্রমিক টুকরা ফ্লুরোসেন্ট ট্যাগ দ্বারা নির্ধারণ করা যেতে পারে।
Exome এবং RNA সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কী?
এক্সোম বনাম আরএনএ সিকোয়েন্সিং |
|
| এক্সোম সিকোয়েন্সিং হল একটি জীবে উপস্থিত এক্সন বা কোডিং ডিএনএ অঞ্চলের সম্পূর্ণ সেটের সিকোয়েন্সিং। | RNA সিকোয়েন্সিং বলতে রিবোনিউক্লিক অ্যাসিড (RNA) এর সিকোয়েন্সিং পদ্ধতিকে বোঝায়; প্রতিলিপি। |
| শুরু নমুনা | |
| জিনোমিক ডিএনএ হল এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের শুরুর নমুনা। | RNA হল আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের শুরুর নমুনা৷ |
| কম্পোজিশন | |
| এতে এক্সনস নামে পরিচিত মোট ডিএনএর শুধুমাত্র কোডিং অঞ্চল রয়েছে | এতে RNA-mRNA / ট্রান্সক্রিপ্টোম রয়েছে। |
| সিকোয়েন্সিং | |
| এক্সোম সিকোয়েন্সিংয়ের দুটি প্রধান পদ্ধতি রয়েছে; সমাধান ভিত্তিক এবং অ্যারে ভিত্তিক প্রযুক্তি। | আরএনএ সিকোয়েন্সিং মোট আরএনএ বা খণ্ডিত আরএনএ বের করে একটি সিডিএনএ লাইব্রেরি তৈরির মাধ্যমে করা হয়। |
সারাংশ – এক্সোম বনাম আরএনএ সিকোয়েন্সিং
Exome হল একটি জীবের কোডিং অঞ্চলের সম্পূর্ণ সেট এবং Exome-এর সঠিক নিউক্লিওটাইড ক্রম নির্ধারণের সাথে জড়িত কৌশলগুলিকে exome সিকোয়েন্সিং বলা হয়। আরএনএ সিকোয়েন্সিং হল একটি জীবের আরএনএর নিউক্লিওটাইড ক্রম নির্ধারণের সাথে জড়িত কৌশল। এটি এক্সোম এবং আরএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্যে পার্থক্য৷
Exome বনাম RNA সিকোয়েন্সিং এর PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন
আপনি এই নিবন্ধটির PDF সংস্করণ ডাউনলোড করতে পারেন এবং উদ্ধৃতি নোট অনুসারে অফলাইন উদ্দেশ্যে এটি ব্যবহার করতে পারেন। দয়া করে এখানে PDF সংস্করণ ডাউনলোড করুন Exome এবং RNA সিকোয়েন্সিং এর মধ্যে পার্থক্য
