এলটিআর এবং নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন হল এক ধরনের রেট্রোট্রান্সপোসন যেগুলির গঠনে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি থাকে, অন্যদিকে নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন হল এক ধরনের রেট্রোট্রান্সপোসন যার দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি হয় না। তাদের কাঠামোতে।
রেট্রোট্রান্সপোসন (শ্রেণী I ট্রান্সপোজেবল উপাদান বা RNA ইন্টারমিডিয়েটের মাধ্যমে ট্রান্সপোসন) হল এক ধরনের জেনেটিক উপাদান যা বিভিন্ন জিনোমিক অবস্থানে নিজেদেরকে কপি করে পেস্ট করতে পারে। তারা আরএনএ ট্রান্সপোজিশন ইন্টারমিডিয়েট ব্যবহার করে রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন নামক একটি প্রক্রিয়ার মাধ্যমে আরএনএকে আবার ডিএনএ-তে রূপান্তর করে এটি সম্পাদন করে।এলটিআর এবং নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন হিসাবে দুটি প্রধান ধরণের রেট্রোট্রান্সপোসন রয়েছে
LTR রেট্রোট্রান্সপোসন কি?
LTR রেট্রোট্রান্সপোসন হল এক ধরণের রেট্রোট্রান্সপোসন যেগুলির গঠনে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি থাকে। LTR রেট্রোট্রান্সপোসনের প্রতিটি প্রান্তে পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএর দীর্ঘ স্ট্র্যান্ড পাওয়া যায়। এগুলো লং টার্মিনাল রিপিটস (LTR) নামে পরিচিত। প্রতিটি এলটিআর কয়েকশ বেস জোড়া লম্বা। LTR রেট্রোট্রান্সপোসন সাধারণত 5 কিলোবেসের বেশি লম্বা হয়। তদুপরি, দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তির মধ্যে, এমন কিছু জিন রয়েছে যা রেট্রোভাইরাস জিন গ্যাগ এবং পোলের সমতুল্য প্রতিলিপি করা যেতে পারে। এই জিনগুলি ওভারল্যাপ করে যাতে তারা একটি প্রোটিজ এনকোড করে যা সাধারণত কার্যকরী জিন পণ্যগুলিতে ফলস্বরূপ প্রতিলিপি প্রক্রিয়া করে৷
চিত্র 01: LTR Retrotransposons
রেট্রোট্রান্সপোসনের গ্যাগ জিন এমন একটি পণ্য তৈরি করে যা অন্যান্য রেট্রোট্রান্সপোসন ট্রান্সক্রিপ্টের সাথে সংযুক্ত করে ভাইরাসের মতো কণা তৈরি করে। পল জিন এমন পণ্য তৈরি করে যাতে এনজাইম অন্তর্ভুক্ত থাকে যেমন রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেজ, ইন্টিগ্রেজ এবং রিবোনুক্লিজ এইচ ডোমেন। বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ এনজাইম রেট্রোট্রান্সপোসন ডিএনএর বিপরীত প্রতিলিপি বহন করে। ইন্টিগ্রেস এনজাইম রেট্রোট্রান্সপোসন ডিএনএকে ইউক্যারিওটিক জিনোম ডিএনএ-তে সংহত করে। রিবোনিউক্লিজ এইচ ডোমেইনগুলি আরএনএ ইন্টারমিডিয়েটগুলির মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ধন ছিন্ন করতে সহায়ক। এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনগুলি টিআরএনএ বাইন্ডিং সাইটগুলির সাথে প্রতিলিপিগুলিকে এনকোড করে যাতে তারা খুব সহজে বিপরীত প্রতিলিপির মধ্য দিয়ে যেতে পারে। অধিকন্তু, যেহেতু রেট্রোট্রান্সপোসনে ইউক্যারিওটিক জিনোমের তথ্য রয়েছে, তাই এটি একটি ইউক্যারিওটিক কোষের মধ্যে অন্যান্য জিনোমিক অবস্থানে নিজের কপি সন্নিবেশ করতে পারে।
Non-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন কি?
Non-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন হল এক ধরনের রেট্রোট্রান্সপোসন যেগুলির গঠনে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি নেই।এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের মতো, নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনেও রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেজ, আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন, নিউক্লিজ এবং কখনও কখনও রিবোনুক্লিজ এইচ ডোমেনের জন্য জিন থাকে। কিন্তু তারা দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি অভাব; পরিবর্তে, তাদের সংক্ষিপ্ত পুনরাবৃত্তি রয়েছে যা একে অপরের পাশে ভিত্তিগুলির একটি উল্টানো ক্রম থাকতে পারে। আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিনগুলি আরএনএ ট্রান্সপোজিশন ইন্টারমিডিয়েটের সাথে আবদ্ধ হয় এবং নিউক্লিয়াসগুলি নিউক্লিক অ্যাসিডের নিউক্লিওটাইডগুলির মধ্যে ফসফোডিস্টার বন্ধন ভেঙে দেয়।
চিত্র 02: LTR এবং Non-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন
যদিও তারা রেট্রোট্রান্সপোসন, তারা LTR রেট্রোট্রান্সপোসনের মতো একইভাবে RNA মধ্যবর্তী ব্যবহার করে বিপরীত প্রতিলিপি চালাতে পারে না। এর কারণ হল নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনগুলিতে এমন ক্রম থাকে না যা টিআরএনএকে আবদ্ধ করে। তাই, একটি নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন এমআরএনএ-তে প্রতিলিপিকৃত এবং প্রোটিনে অনুবাদ করা বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেস হিসাবে কাজ করে।বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেজ নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের আরএনএর একটি ডিএনএ অনুলিপি তৈরি করে যা একটি নতুন সাইটে জিনোমে একত্রিত করা যেতে পারে। অধিকন্তু, নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসন দুটি প্রকারে পড়ে: লাইন (দীর্ঘ ছেদযুক্ত পারমাণবিক উপাদান) এবং SINE (সংক্ষিপ্ত ছেদযুক্ত পারমাণবিক উপাদান)।
LTR এবং নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসনের মধ্যে মিল কী?
- LTR এবং নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন হল দুটি প্রধান ধরনের রেট্রোট্রান্সপোসন।
- উভয় প্রকারেই এনজাইমের জন্য জিন থাকে যেমন রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেজ, আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন, নিউক্লিজ এবং রিবোনুক্লিজ এইচ ডোমেন।
- এগুলি মানুষের জিনোমে পাওয়া যায়।
- উভয় প্রকারই বিবর্তনীয় গুরুত্বপূর্ণ।
LTR এবং নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসনের মধ্যে পার্থক্য কী?
LTR রেট্রোট্রান্সপোসনের কাঠামোতে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি থাকে, যখন নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের গঠনে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তির অভাব থাকে।সুতরাং, এটি এলটিআর এবং নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের মধ্যে মূল পার্থক্য। অধিকন্তু, এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের দীর্ঘ প্রত্যক্ষ পুনরাবৃত্তি রয়েছে যা নিজেদের পুনরাবৃত্তি ঘাঁটির একটি ক্রম মাত্র। অন্যদিকে, নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের সংক্ষিপ্ত পুনরাবৃত্তি রয়েছে যেগুলির একে অপরের পাশে ঘাঁটির একটি উল্টানো ক্রম থাকতে পারে।
নীচের ইনফোগ্রাফিকটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য সারণী আকারে এলটিআর এবং নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের মধ্যে পার্থক্য উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – LTR বনাম নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন
LTR এবং নন-LTR রেট্রোট্রান্সপোসন দুটি প্রধান ধরনের রেট্রোট্রান্সপোসন। এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের কাঠামোতে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি থাকে, যখন নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের কাঠামোতে দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তি থাকে না। সুতরাং, এটি এলটিআর এবং নন-এলটিআর রেট্রোট্রান্সপোসনের মধ্যে মূল পার্থক্য।
