এনজিএস এবং ডব্লিউজিএস-এর মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে নেক্সট-জেনারেশন সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) হল একটি ব্যাপক সমান্তরাল দ্বিতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা উচ্চ থ্রুপুট, কম খরচে এবং দ্রুত, যেখানে পুরো-জিনোম সিকোয়েন্সিং (ডব্লিউজিএস) হল সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং, শটগান অ্যাপ্রোচ বা হাই থ্রুপুট এনজিএস সিকোয়েন্সিং-এর মতো সিকোয়েন্সিং কৌশল ব্যবহার করে একক সময়ে একটি কোষের সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ বিশ্লেষণ করার একটি ব্যাপক পদ্ধতি।
গত কয়েক দশকে, দ্রুত সিকোয়েন্সিং কৌশল এবং বায়োইনফরমেটিক্স টুলস আবিষ্কারের কারণে মানুষ এবং অন্যান্য প্রাণীর জিনোম বোঝা ব্যাপকভাবে বৃদ্ধি পেয়েছে। স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিংয়ের মতো প্রচলিত সিকোয়েন্সিং কৌশলগুলির সীমাবদ্ধতা ছিল, যা নেক্সট-জেনারেশন সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) এবং ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিংয়ের মতো নতুন দ্রুত সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির বিকাশের আহ্বান জানিয়েছে।পুরো-জিনোম সিকোয়েন্সিং (WGS) কৌশলটি একটি সাম্প্রতিক পদ্ধতি যা ইতিমধ্যেই অনেক জিনোমিক গবেষণা প্রকল্পে ব্যবহৃত হয়েছে, যেমন জিনোমিক ইংল্যান্ড, যুক্তরাজ্যের 100, 000 জিনোমিক প্রকল্প। সুতরাং, NGS এবং WGS হল দুটি সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা বর্তমানে অনেক জিনোমিক প্রকল্পে অন্তর্ভুক্ত করা হচ্ছে।
NGS কি?
NGS (পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং) একটি ব্যাপকভাবে সমান্তরাল দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা উচ্চ থ্রুপুট, কম খরচে এবং দ্রুত। পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য কোন সুনির্দিষ্ট সংজ্ঞা নেই। তবে আমরা এটিকে প্রচলিত কৈশিক-ভিত্তিক সিকোয়েন্সিং কৌশল থেকে স্পষ্টভাবে আলাদা করতে পারি। পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং একটি একক পরীক্ষায় 1 মিলিয়ন বেস জোড়ার চেয়ে বড় আকারের একটি ডিএনএ অণুর সিকোয়েন্সিংকে অনুমতি দেয়। এটি অভূতপূর্ব গতি এবং উচ্চ থ্রুপুট বিকল্পগুলি অফার করে, যেমন একই সময়ে একাধিক ব্যক্তির ডিএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের অনুমতি দেওয়া। এটি পৃথক সিকোয়েন্সিং প্রতিক্রিয়াগুলির ভলিউমকে ছোট করে অর্জন করা হয়। তদুপরি, এটি যন্ত্রের আকারকেও সীমিত করে এবং প্রতি প্রতিক্রিয়া প্রতি বিকারকের খরচ কমিয়ে দেয়।
চিত্র ০১: এনজিএস প্ল্যাটফর্ম
NGS হল একটি সংক্ষিপ্ত-পঠিত সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা ইতিমধ্যে জৈবিক গবেষণা ক্ষেত্রে বিপ্লব ঘটিয়েছে। অধিকন্তু, এনজিএস বিভিন্ন ক্ষেত্রে প্রয়োগ করা হয় যেমন ডি নভো জিনোম সিকোয়েন্সিং, পুরো-জিনোম সিকোয়েন্সিং, ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণ, ছোট আরএনএ এবং মাইক্রো আরএনএ সিকোয়েন্সিং, টার্গেটেড রিকোয়েন্সিং এবং পুরো-এক্সোম সিকোয়েন্সিং।
WGS কি?
WGS (সম্পূর্ণ-জিনোম সিকোয়েন্সিং) হল সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং, শটগান অ্যাপ্রোচ বা উচ্চ থ্রুপুট এনজিএস সিকোয়েন্সিং-এর মতো সিকোয়েন্সিং কৌশল ব্যবহার করে একক সময়ে একটি কোষের সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ বিশ্লেষণ করার একটি ব্যাপক পদ্ধতি। এটি সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং বা সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং নামেও পরিচিত। সম্পূর্ণ-জিনোম সিকোয়েন্সিং একটি জীবের সমস্ত ক্রোমোসোমাল ডিএনএ এর পাশাপাশি মাইটোকন্ড্রিয়াতে ডিএনএ এবং উদ্ভিদের জন্য, ক্লোরোপ্লাস্টের ডিএনএ একক সময়ে সিকোয়েন্সিংকে অন্তর্ভুক্ত করে।ডাব্লুজিএস বিজ্ঞানীদের ডিএনএর সম্পূর্ণ সেট তৈরি করে এমন সমস্ত অক্ষরের সঠিক ক্রম পড়তে সক্ষম করে। NGS প্ল্যাটফর্ম ব্যবহার করে WGS ক্লিনিকাল সেটআপে বিপ্লব ঘটাবে বলে আশা করা হচ্ছে।
চিত্র 02: WGS বনাম হায়ারার্কিক্যাল শটগান সিকোয়েন্সিং
হোল-জিনোম সিকোয়েন্সিং 2014 সালে ক্লিনিকাল কেয়ারে চালু করা হয়েছিল। উপরন্তু, WGS-এর প্রয়োগে এসএনপি স্তরে জিন সিকোয়েন্সিং জড়িত থাকে যাতে অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিতে কার্যকরী ভেরিয়েন্টগুলি চিহ্নিত করা যায়, ব্যক্তিগতকৃত ওষুধে থেরাপিউটিক হস্তক্ষেপ, বিবর্তনীয় জীববিজ্ঞান, তুলনামূলকভাবে জিনোম পদ্ধতি।, মিউটেশন এবং পুনর্বিন্যাস অধ্যয়ন, বিরল বৈকল্পিক অ্যাসোসিয়েশন অধ্যয়ন, এবং রোগের সংবেদনশীলতা এবং ওষুধের প্রতিক্রিয়ার পূর্বাভাস।
NGS এবং WGS-এর মধ্যে মিল কী?
- NGS এবং WGS দুটি সিকোয়েন্সিং কৌশল।
- উভয় কৌশলই ডিএনএ বা আরএনএ সিকোয়েন্স করে।
- এই কৌশলগুলি নতুন এবং নির্ভরযোগ্য৷
- এগুলি উভয়ই রোগ নির্ণয় এবং ওষুধ আবিষ্কারে ব্যবহৃত হয়৷
NGS এবং WGS-এর মধ্যে পার্থক্য কী?
NGS হল একটি ব্যাপক সমান্তরাল দ্বিতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা উচ্চ থ্রুপুট, কম খরচে এবং দ্রুত, অন্যদিকে WGS হল সিকোয়েন্সিং কৌশলগুলি ব্যবহার করে একক সময়ে একটি কোষের সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ বিশ্লেষণ করার একটি ব্যাপক পদ্ধতি যেমন সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং, শটগান অ্যাপ্রোচ বা হাই থ্রুপুট এনজিএস সিকোয়েন্সিং। সুতরাং, এটি NGS এবং WGS এর মধ্যে মূল পার্থক্য। উপরন্তু, NGS শুধুমাত্র দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি নিয়ে গঠিত যেখানে WGS প্রথম, দ্বিতীয় এবং তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি নিয়ে গঠিত।
নিম্নলিখিত সারণীটি পাশাপাশি তুলনা করার জন্য এনজিএস এবং ডাব্লুজিএস এর মধ্যে পার্থক্যগুলিকে সারণী আকারে উপস্থাপন করে৷
সারাংশ – NGS বনাম WGS
গত দশকগুলিতে, সমসাময়িক আণবিক গবেষণায় নিয়মিতভাবে বিভিন্ন সিকোয়েন্সিং কৌশল প্রয়োগ করা হয়েছে। এমনকি তারা অনেক ক্লিনিকাল অ্যাপ্লিকেশনের জন্য খুব শক্তিশালী সরঞ্জাম। NGS এবং WGS হল দুটি সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা বর্তমানে অনেক জিনোমিক প্রকল্পে অন্তর্ভুক্ত করা হচ্ছে। NGS হল একটি দ্বিতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা উচ্চ থ্রুপুট, কম খরচে এবং দ্রুত। অন্যদিকে, ডাব্লুজিএস হল সেঞ্জার সিকোয়েন্সিং, শটগান অ্যাপ্রোচ বা উচ্চ থ্রুপুট এনজিএস সিকোয়েন্সিংয়ের মতো সিকোয়েন্সিং কৌশল ব্যবহার করে একক সময়ে একটি কোষের সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ বা সম্পূর্ণ জিনোমিক ডিএনএ বিশ্লেষণ করার একটি পদ্ধতি। সুতরাং, এই হল NGS এবং WGS এর মধ্যে পার্থক্যের সারাংশ।
